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Características sinonimo
Otra palabra para las características en biología
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Sinónimo de atributos clave
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Rasgos característicos sinónimos
La infección por el virus de la hepatitis B (VHB) es uno de los principales problemas de salud humana y causa una infección crónica a gran escala de pacientes en todo el mundo.. Dado que la replicación del VHB depende de su sistema celular anfitrión, el patrón de uso de codones para el gen viral podría ser susceptible de dos selecciones principales, a saber, la presión de mutación y la selección de traducción. En este caso, una investigación más profunda entre la evolución del VHB y la respuesta adaptativa del huésped podría ayudar a controlar esta enfermedad.
Los valores de uso relativo de codones sinónimos (RSCU) para toda la secuencia de codificación del VHB se estudiaron mediante el análisis de componentes principales (PCA). Las características de los patrones de uso de codones sinónimos, los contenidos de los nucleótidos y la comparación entre los valores de ENC de toda la secuencia codificante del VHB indicaron que la interacción entre la presión de mutación del virus y la selección de traducción del huésped existe en los procesos de evolución del VHB. El patrón de uso de codones sinónimos del VHB es una mezcla de coincidencia y antagonismo con el de la célula huésped. Sin embargo, no se observó la diferencia de las características genéticas del VHB con respecto a sus diferentes áreas epidémicas o subtipos, lo que sugiere que el factor geográfico es limitado para influir en la evolución de este virus, mientras que las características genéticas basadas en los genotipos del VHB podrían dividirse en tres grupos, a saber: (i) genotipos A y E, (ii) genotipo B, (iii) genotipos C, D y G.
Características humanas sinónimo
La adaptación del patrón general de uso de codones del virus del Nilo Occidental (VNO) al de dos huéspedes se estimó a partir del valor de uso de codones sinónimos (RSCU). También se analizaron los sesgos de uso de codones sinónimos para la secuencia de codificación inicial de este virus, calculando la fluctuación de uso para cada codón sinónimo a lo largo de la región objetivo (los primeros 270 sitios de codones de toda la secuencia de codificación del VNO). La adaptación del VNO a Anopheles gambiae en cuanto al uso general de codones reveló una mezcla de patrones de uso de codones sinónimos entre este virus y su vector. En lo que respecta a la adaptación del VNO a su hospedador y al uso de codones, aunque existe una mezcla de patrones globales de uso de codones, el número de codones con tendencia inversa al uso de codones es menor que entre el virus y su vector. Además, algunos codones con valores de RSCU bajos para este virus están altamente seleccionados en la región de traducción inicial del VNO, mientras que los codones con valores de RSCU bajos en esta región tienden a emparejarse con ARNt presentes en baja abundancia en el hospedador, lo que sugiere que los codones altamente seleccionados en una región específica en la región inicial del VNO están, hasta cierto punto, influenciados por la correspondiente baja abundancia de ARNt de los hospedadores para regular la velocidad de traducción de la poliproteína del VNO.